MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 14022

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016112	A	6	6	1610867	1610872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_016112	ATG	2	6	1610914	1610919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_016112	T	6	6	1611843	1611848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_016112	TCA	2	6	1614271	1614276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_016112	CGA	2	6	1616518	1616523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_016112	C	6	6	1616558	1616563	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5007	NC_016112	AGTTA	2	10	1616611	1616620	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_016112	A	6	6	1616641	1616646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_016112	AGA	2	6	1616692	1616697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_016112	AAC	2	6	1616706	1616711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_016112	AAAGAT	2	12	1616721	1616732	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_016112	CGT	2	6	1616820	1616825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_016112	CCT	2	6	1617074	1617079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5014	NC_016112	A	6	6	1617114	1617119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_016112	T	6	6	1617150	1617155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_016112	CCAT	2	8	1617254	1617261	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5017	NC_016112	AAT	2	6	1617296	1617301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_016112	TG	3	6	1619921	1619926	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_016112	GTT	2	6	1620011	1620016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_016112	CT	3	6	1620061	1620066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5021	NC_016112	ATG	2	6	1621669	1621674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_016112	GCTT	2	8	1621703	1621710	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5023	NC_016112	TAG	2	6	1629834	1629839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_016112	ATC	2	6	1629899	1629904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_016112	GT	3	6	1629924	1629929	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_016112	GA	3	6	1630006	1630011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_016112	GATG	2	8	1630038	1630045	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_016112	GGT	2	6	1630166	1630171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_016112	T	6	6	1630181	1630186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_016112	GTT	2	6	1630230	1630235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_016112	CAG	2	6	1630239	1630244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_016112	AGG	2	6	1630893	1630898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_016112	ATTT	2	8	1632326	1632333	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_016112	ATC	3	9	1632334	1632342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_016112	CCA	2	6	1632396	1632401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5036	NC_016112	CGAT	2	8	1632423	1632430	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5037	NC_016112	GCA	2	6	1640659	1640664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_016112	TA	3	6	1640817	1640822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_016112	AAG	2	6	1640839	1640844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_016112	GCA	2	6	1640910	1640915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_016112	CCAT	2	8	1640983	1640990	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5042	NC_016112	GGC	2	6	1640998	1641003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_016112	CTGCC	2	10	1641103	1641112	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5044	NC_016112	A	6	6	1642515	1642520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_016112	GAA	2	6	1642533	1642538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_016112	AAG	2	6	1642540	1642545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_016112	ATT	2	6	1642576	1642581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_016112	GGCA	2	8	1642638	1642645	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5049	NC_016112	CTA	2	6	1642648	1642653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_016112	TCAA	2	8	1642886	1642893	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5051	NC_016112	GT	3	6	1643129	1643134	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_016112	CTT	2	6	1644740	1644745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_016112	ACA	2	6	1644953	1644958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_016112	ATT	2	6	1644971	1644976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_016112	AAT	2	6	1645106	1645111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_016112	TATC	2	8	1645139	1645146	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5057	NC_016112	GCA	2	6	1645205	1645210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_016112	TTG	2	6	1645328	1645333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_016112	A	6	6	1645384	1645389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_016112	TG	3	6	1645410	1645415	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_016112	TA	3	6	1645416	1645421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_016112	CCAT	2	8	1645508	1645515	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5063	NC_016112	GCA	2	6	1645535	1645540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_016112	TA	3	6	1645694	1645699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_016112	T	6	6	1645707	1645712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_016112	ATT	2	6	1645723	1645728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_016112	AATT	2	8	1648467	1648474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_016112	TAA	2	6	1649985	1649990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_016112	AAG	2	6	1651076	1651081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_016112	TC	3	6	1651101	1651106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5071	NC_016112	TA	3	6	1651429	1651434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_016112	TTGCT	2	10	1651476	1651485	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5073	NC_016112	A	6	6	1651491	1651496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_016112	TGT	2	6	1651511	1651516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_016112	GAT	2	6	1651635	1651640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_016112	CTC	2	6	1651680	1651685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5077	NC_016112	GGC	2	6	1656912	1656917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_016112	CGC	2	6	1656923	1656928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5079	NC_016112	GCATA	2	10	1657242	1657251	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5080	NC_016112	AGC	2	6	1657272	1657277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_016112	GAG	2	6	1657357	1657362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_016112	GAT	2	6	1658628	1658633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_016112	GAT	2	6	1658654	1658659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_016112	TGC	2	6	1658689	1658694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_016112	TCCT	2	8	1658875	1658882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5086	NC_016112	CCT	2	6	1658909	1658914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5087	NC_016112	TTC	2	6	1659008	1659013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_016112	GTT	2	6	1661389	1661394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_016112	GC	3	6	1661421	1661426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5090	NC_016112	ATA	2	6	1662188	1662193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_016112	AAG	2	6	1663487	1663492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_016112	CGT	2	6	1664305	1664310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_016112	GC	3	6	1665741	1665746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5094	NC_016112	CTC	2	6	1665747	1665752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5095	NC_016112	TA	3	6	1665783	1665788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_016112	GGA	2	6	1665823	1665828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_016112	AT	3	6	1666194	1666199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_016112	CGTC	2	8	1666229	1666236	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5099	NC_016112	TAACCA	2	12	1666279	1666290	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_016112	CCT	2	6	1666383	1666388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5101	NC_016112	AGC	2	6	1666571	1666576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_016112	TTA	2	6	1666640	1666645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_016112	TGAA	2	8	1668106	1668113	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_016112	AGC	2	6	1668154	1668159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_016112	AGG	2	6	1668223	1668228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_016112	TAA	2	6	1669836	1669841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_016112	CTT	2	6	1669903	1669908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_016112	AAATTA	2	12	1669921	1669932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_016112	A	6	6	1670276	1670281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_016112	T	6	6	1670308	1670313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_016112	TGA	2	6	1673302	1673307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_016112	GGTC	2	8	1673369	1673376	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5113	NC_016112	ATGG	2	8	1673494	1673501	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_016112	GAG	2	6	1673567	1673572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_016112	CTT	2	6	1673596	1673601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_016112	CGA	2	6	1673674	1673679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_016112	A	7	7	1674498	1674504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_016112	CTTAG	2	10	1674579	1674588	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5119	NC_016112	TATTC	2	10	1674605	1674614	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5120	NC_016112	T	6	6	1674622	1674627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_016112	TATCT	2	10	1674634	1674643	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5122	NC_016112	GTC	2	6	1677282	1677287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_016112	TAA	2	6	1678266	1678271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_016112	GCA	2	6	1678276	1678281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_016112	ACA	2	6	1678340	1678345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_016112	T	6	6	1678429	1678434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_016112	GCC	2	6	1679830	1679835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5128	NC_016112	GCC	2	6	1679852	1679857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5129	NC_016112	CTT	2	6	1679862	1679867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_016112	ATT	2	6	1684230	1684235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_016112	CTG	2	6	1684265	1684270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5132	NC_016112	ATT	2	6	1684287	1684292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_016112	TGG	2	6	1684375	1684380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5137	NC_016112	TCGA	2	8	1684533	1684540	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5151	NC_016112	CCTA	2	8	1691037	1691044	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5252	NC_016112	AG	3	6	1745245	1745250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5253	NC_016112	TAAA	2	8	1745286	1745293	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5254	NC_016112	A	6	6	1745388	1745393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5255	NC_016112	TGT	2	6	1746334	1746339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5256	NC_016112	T	6	6	1746390	1746395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5257	NC_016112	ATT	2	6	1746398	1746403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_016112	TGC	2	6	1746424	1746429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5259	NC_016112	GC	3	6	1746502	1746507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5260	NC_016112	TAA	2	6	1746529	1746534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5261	NC_016112	CGA	2	6	1746563	1746568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5262	NC_016112	GATC	2	8	1746572	1746579	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5263	NC_016112	GAT	2	6	1746584	1746589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5272	NC_016112	CG	3	6	1747505	1747510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5398	NC_016112	ATG	2	6	1796869	1796874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5400	NC_016112	GTT	2	6	1797395	1797400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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